مسمومیت ناشی از استفاده بیش از اندازة کودهای شیمیایی که در اثر جذب بیش از حد آن اتفاق می‌افتد، باعث افزایش غلظت آن‌ها در بافت‌های گیاهی و به هم خوردن تعادل عناصر غذایی می‌گردد و آثار زیر را به دنبال دارد:

1. کاهش کمیت و کیفیت (عطر و طعم) محصول
2. تحمیل هزینه هنگفت به کشاورزان
3. تجمع فلزات سنگین مانند کادمیوم، اورانیوم و بور در خاک و در گیاه
4. کاهش جذب مس،‌ آهن، روی و سایر ریز مغذی‌ها توسط ریشه
5. تخریب ساختمان خاک
6. آلودگی آبها به مواد شیمیایی علاوه بر اینکه موجب رشد بیش از حد جلبک‌ها شده و مرگ و میر آبزیان را به دنبال دارد، موجب آلودگی منابع آب آشامیدنی می‌گردد